A Chooz et Nogent-sur-Seine, les campagnes de mesures réalisées à partir de 2001 sur les rejets engendrés par le traitement anti-amibes ont révélé des quantités significatives de nitrates et, dans une moindre mesure, de nitrites (voir tableau ci-dessous). Ces rejets étaient susceptibles de dépasser les seuils d'autorisation existants alors au titre de la loi sur l'eau. C'est pourquoi, afin de régulariser cette situation maintenant beaucoup mieux appréhendée, EDF avait déposé en décembre 2002 des nouveaux dossiers en vue d'obtenir la modification des conditions de rejet imposées aux centrales.
L'arrêté correspondant a été signé en avril 2004 pour la centrale de Chooz.
Pour la centrale de Nogent, cette situation a été traitée par l'arrêté du 29 décembre 2004, renouvelant son autorisation générale de prélèvement d'eau et de rejets.

REJETS POUR LA SAISON 2005